การตอบสนองของเซลล์ต่อความเครียดที่แตกต่างกัน

การตอบสนองของเซลล์ต่อความเครียดที่แตกต่างกันจำนวนมากด้วยความงุนงงกับรูปแบบที่เกิดขึ้นซ้ำผู้เขียนจึงถามว่ามันสะท้อนให้เห็นถึงการตอบสนองทางชีววิทยาสากลที่ใช้ร่วมกับทริกเกอร์ที่แตกต่างกันเพื่อจัดการกับคำถามนี้พวกเขาเปรียบเทียบทำซ้ำตัวอย่างจากสภาพทางชีววิทยาเดียวกันความแตกต่างในการแสดงออกของยีนระหว่างการจำลอง

สามารถสะท้อนผลกระทบทางเทคนิคที่ไม่เกี่ยวข้องกับปัจจัยทางชีววิทยาของการทดลองที่น่าสนใจ โดยไม่คาดคิดรูปแบบเดียวกันโดยเฉพาะอย่างยิ่งยีนสั้นหรือยาวที่แสดงการเปลี่ยนแปลงในระดับการแสดงออกถูกสังเกตในการเปรียบเทียบเหล่านี้ระหว่างการจำลองแบบแสดงให้เห็นว่ารูปแบบนี้เป็นผลมาจากอคติทางเทคนิคที่ดูเหมือนจะควบคู่กับความยาวของยีนเป้าหมายหลักของการทดลอง RNA-seq คือการระบุลักษณะของกระบวนการทางชีวภาพที่มีการกระตุ้นหรือปราบปรามในการตอบสนองต่อเงื่อนไขที่น่าสนใจ โดยเฉพาะอย่างยิ่งกระบวนการทางชีวภาพที่เฉพาะเจาะจงจะถูกดำเนินการโดยผลิตภัณฑ์ของยีนสั้นและระยะยาว ตัวอย่างเช่นยีนสั้นจำนวนมากเข้ารหัสโปรตีนที่ประกอบด้วยไรโบโซมซึ่งเป็นกลไกการสร้างโปรตีนของเซลล์ ในทางกลับกันยีนยาวจำนวนมากเข้ารหัสโปรตีนที่ประกอบด้วยเมทริกซ์เสริมเซลลูลาร์ ซึ่งเป็นเครือข่ายของโมเลกุลขนาดใหญ่ที่ให้เซลล์ด้วยการสนับสนุนโครงสร้างภายนอก